Žydrūnas reiškia „žydras“, „mėlynas“ arba „dangiškos spalvos“. Šis aiškinimas siejamas su lietuvišku žodžiu „žydras“, reiškiančiu šviesiai mėlyną spalvą. Pažodinis reikšmės vertimas į bendrinę lietuvių kalbą yra „mėlynas“ arba „žydras“.
Spalvos reikšmė įvairiose kultūrose aiškinama skirtingai. Europos tradicijose mėlyna spalva dažnai siejama su dangumi, vandeniu, ramybe ir tvarka. Krikščioniškoje simbolikoje mėlyni atspalviai kartais siejami su dangumi ir dvasiniu susikaupimu. Šie aiškinimai yra kultūrinės interpretacijos, o ne tiesioginė vardo reikšmė.
Kai kuriuose vardų aiškinimuose Žydrūnas siejamas su žydrumo, dangaus arba giedro dangaus įvaizdžiu. Tai platesnė simbolinė interpretacija, paremta spalvos asociacijomis. Pagrindinė kalbinė reikšmė išlieka susijusi su žydra spalva.
Žydrūnas nėra aiškinamas kaip religinis vardas. Jo reikšmė remiasi kasdienės lietuvių kalbos žodžiu. Skirtingais laikotarpiais žydra spalva galėjo būti suvokiama kaip dangaus skaidrumo, vandens švarumo arba tolio ženklas. Tokie vaizdiniai priklauso nuo kultūrinio konteksto ir asmeninio suvokimo.
