Vardo Salys tiesioginė reikšmė nėra patikimai nustatyta. Lietuvių vardyne ši forma gali būti siejama su žodžiu „sala“, reiškiančiu sausumos plotą, apsuptą vandens. Toks aiškinimas išlieka hipotetinis, nes trūksta senųjų rašytinių šaltinių.
Kitas galimas aiškinimas sieja Salys su krikščioniškos kilmės vardų formomis, pavyzdžiui, Saliamonu. Tokiu atveju reikšmė būtų aiškinama per hebrajų kalbos žodį „šalom“, lietuviškai reiškiantį taiką arba ramybę. Ši sąsaja nėra visuotinai pripažinta.
Simboliniu lygmeniu sala dažnai reiškia saugumą, atskirtį ir vidinę ramybę. Hebrajiška taikos samprata religinėse tradicijose siejama su darna, gerove ir santarve. Šios interpretacijos priklauso kultūriniam simbolizmui, o ne patvirtintai vardo reikšmei.
Skirtingais laikotarpiais trumpi vardai galėjo atsirasti iš ilgesnių vardų arba šeimos vartosenos. Todėl Salys reikšmė gali būti aiškinama keliais būdais, tačiau nė vienas jų nėra galutinai įrodytas. Šiandien Salys pirmiausia suvokiamas kaip savitas lietuviškoje aplinkoje vartojamas vyriškas vardas.
