Nerius dažniausiai siejamas su lietuvišku hidronimu „Neris“. Lietuvių kalboje šis žodis pirmiausia reiškia upės vardą, o ne bendrinį daiktavardį. Tiesioginis vertimas į kitą kalbą nėra nusistovėjęs. Reikšmė dažnai perteikiama kaip „upė“, „tekantis vanduo“ arba „vandens kelias“.
Vanduo įvairiose kultūrose simbolizuoja gyvybę, judėjimą ir nuolatinę kaitą. Upė baltų tradicijose siejama su kraštovaizdžiu, kelione ir gyvenamąja erdve. Šios sąsajos yra simbolinės, todėl jos neapibrėžia oficialios vardo reikšmės. Nerius gali būti aiškinamas kaip vardas, susijęs su gamtos jėga ir vandens tėkme.
Kalbininkai nėra pateikę vienintelio visuotinai pripažinto šio hidronimo aiškinimo. Kai kuriuose aiškinimuose pabrėžiamas vandens judėjimas arba sraunumas. Kitos versijos sieja pavadinimą su senesniais baltų vandenvardžiais. Nerius nėra tikslus žodžio „upė“ atitikmuo. Jo reikšmė labiau kyla iš konkretaus Lietuvos upės pavadinimo.
Laikui bėgant gamtinių vardų simbolika keitėsi. Senesnėje aplinkoje upė reiškė praktinį vandens šaltinį ir susisiekimo kelią. Šiuolaikiniame vardų aiškinime dažniau pabrėžiama gamtos, tėkmės ir gyvybingumo simbolika.
